Conforme a la gestión intermediada de los fondos, dos o más organizaciones desarrollan un fondo fiduciario de asociados múltiples o un programa conjunto. Si los donantes y las organizaciones participantes de las Naciones Unidas acuerdan canalizar los fondos a las organizaciones participantes a través de una organización de las Naciones Unidas, aplica la modalidad intermediada. La organización de las Naciones Unidas que canaliza los recursos, llamada AA (agente administrativo), es seleccionada en forma conjunta por todas las organizaciones participantes.